Logo HQE II
Latar Belakang Putih
- Melambangkan keprihatinan, profesionalisme dan kerja berpasukan anggota Hospital Queen Elizabeth II.
Jalur Bulan Sabit Merah
- Melambangkan bendera Malaysia dan Hospital Queen Elizabeth II sebagai sebuah institusi perubatan.
Warna Kuning
- Melambangkan kecekalan dan disiplin anggota Hospital Queen Elizabeth II dalam perkhidmatan perubatan.
Gunung Kinabalu Bentuk Nadi
- Melambangkan Hospital Queen Elizabeth II sebagai Pusat Rawatan Jantung yang terletak di Sabah, Negeri di Bawah Bayu.
Warna Merah
- Melambangkan kecemerlangan dan kewibawaan anggota Hospital Queen Elizabeth II dalam perkhidmatan.
Warna Biru
- Melambangkan perpaduan dan kerjasama antara semua anggota perubatan dalam perkhidmatan.
Moto "Kami Sedia Membantu"
- Merupakan prinsip-prinsip yang dipegang semasa menjalankan tugas.